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一种基于跨平台基因表达数据的基因调控网络重建方法

作者:DMIR    发表时间:2017-03-30    浏览量:31


发明人:蔡瑞初,林殷娴,郝志峰,温雯,谢峰,许柏炎,陈薇,陈炳丰

申请时间:2017年3月30日

专利申请号:201710201797.5

申请状态:实质审查


说明:本发明涉及一种基于跨平台基因表达数据的基因调控网络重建方法,根据跨平台基因表达数据的特点,通过获取来自p个测序平台基因表达数据,并进行预处理,然后从每个基因样本中抽取n个基因表达量,并基于偏相关系数的混合型条件独立性测试得到每个基因表达量的父子节点集,将其应用于跨平台因果网络结构学习的学习网络骨架、确定v?结构和最大化标志方向三个过程中,从而重建出跨平台基因调控网络,本发明利用因果图模型解决跨平台基因调控网络的问题,能直接有效地利用跨平台基因表达数据进行高维的基因调控网络重建的同时,避免数据预处理过程导致的数据过度平滑等问题,提高了跨平台基因调控网络重建结果的正确率和召回率。

系统设计总图: